כל המיקרוסקופים נועדו לכלול שלב בו מוצב הדגימה (המותקנת בדרך כלל על מגלשת זכוכית) לצורך תצפית. שלבים מצוידים לרוב במכשיר מכני המחזיק את שקופית הדגימה במקום ויכול לתרגם בצורה חלקה את המגלשה קדימה ואחורה כמו גם מצד לצד. ניתן לסווג שלב על פי תכנון ופונקציונליות. במקרה הפשוט ביותר, השלב הפשוט מורכב מעיצוב מלבני או מרובע \ המכיל כמה קליפים להחזקת מגלשת הדגימה.
הבמה היא שלב מלבני טיפוסי עם התכונה הנוספת של מכשיר בקרת תרגום שקופית שקופית המכונה בדרך כלל שלב מכני. שלב מכני זה מכיל בקרות למיקרוסקופים ימניים המאפשרים תנועה של הדגימה שקופית הן בכיווני ה- X (ימין והן משמאל) והן (קדימה ואחורה) כך שהמיקרוסקופיסט יוכל לבחון את כל שקופית המיקרוסקופ (מאובטחת לשלב עם מחזיק השקופית). שלבים מכניים דומים זמינים עם ידיות הבקרה התרגומיות הממוקמות בצד שמאל של הבמה למיקרוסקופים שמאליים. הבמה מכילה גם פתח גדול למדי במרכז כדי לאפשר אור מהקבל לעבור דרך הדגימה (פתיחת הבמה). הבמה מצוידת גם בבקרת נעילה המאפשרת לתקן את הבמה למצב ביחס לסיבוב שלו סביב ציר הקבל. סימני איתור מדורגים המוצבים על החלק המכני של הבמה מאפשרים למיקרוסקופיסט לציין את מיקום פרטי הדגימה החשובים, ומאפשרים חזרה קלה לאזור לקבלת תצפית נוספת או פוטו -מיקרוגרפיה.
שלב מיקרוסקופ פשוט (המכונה בדרך כלל "רגיל"). שלב זה מכיל פתח להודות באור מהקבל, מספר חורי הרכבה לשלב מכני, ושני קליפים המאבטחים את שקופית הדגימה במקום להתבוננות תחת הגדלה הגדלה (שינוי היעדים) ולפוטומיקרוגרפיה. הבמה מצוידת גם בבקרת נעילה שיכולה לתקן את מיקום הבמה. שלב זה שימושי מאוד לבדיקה מהירה של דגימות, אך קשה מאוד לשימוש ביעדי הספק גבוהות יותר (מעל 20X). בהגדלה גבוהה, תרגומים קטנים של שקופית הדגימה בדרך כלל יזרקו את תכונות העניין לחלוטין מהנוף שדה, וניסיון להעתיק אותם יכולים להוביל לתסכול. שלבים מכניים עזר המצורפים לשלב פשוט יכולים לאפשר תרגום דק של מגלשת הדגימה, מה שמקל על המיקרוסקופיסט למצוא אזורים ספציפיים בשקופית.
